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Baky, M. H.; Kamal, I. M.; Wessjohann, L. A.; Farag, M. A.; Assessment of metabolome diversity in black and white pepper in response to autoclaving using MS- and NMR-based metabolomics and in relation to its remote and direct antimicrobial effects against food-borne pathogens RSC Adv. 14 10799-10813 (2024) DOI: 10.1039/d4ra00100a

Publikation

Ninck, S.; Halder, V.; Krahn, J. H.; Beisser, D.; Resch, S.; Dodds, I.; Scholtysik, R.; Bormann, J.; Sewald, L.; Gupta, M. D.; Heilmann, G.; Bhandari, D. D.; Morimoto, K.; Buscaill, P.; Hause, B.; van der Hoorn, R. A. L.; Kaschani, F.; Kaiser, M.; Chemoproteomics Reveals the Pan-HER Kinase Inhibitor Neratinib To Target an Arabidopsis Epoxide Hydrolase Related to Phytohormone Signaling ACS Chem. Biol. 18 1076-1088 (2023) DOI: 10.1021/acschembio.2c00322

Publikation

Farag, M. A.; Baky, M. H.; Morgan, I.; Khalifa, M. R.; Rennert, R.; Mohamed, O. G.; El-Sayed, M. M.; Porzel, A.; Wessjohann, L. A.; Ramadan, N. S.; Comparison of Balanites aegyptiaca parts: metabolome providing insights into plant health benefits and valorization purposes as analyzed using multiplex GC-MS, LC-MS, NMR-based metabolomics, and molecular networking RSC Adv. 13 21471-21493 (2023) DOI: 10.1039/d3ra03141a

Balanites aegyptiaca (L.) Delile (Zygophyllaceae), also known as the desert date, is an edible fruit-producing tree popular for its nutritional and several health benefits. In this study, multi-targeted comparative metabolic profiling and fingerprinting approaches were conducted for the assessment of the nutrient primary and secondary metabolite heterogeneity in different parts, such as leaves, stems, seeds, unripe, and ripe fruits of B. aegyptiaca using nuclear magnetic resonance (NMR), ultra-performance liquid chromatography (UPLC-MS), and gas chromatography mass-spectrometry (GC-MS) based metabolomics coupled to multivariate analyses and in relation to its cytotoxic activities. NMR-based metabolomic study identified and quantified 15 major primary and secondary metabolites belonging to alkaloids, saponins, flavonoids, sugars, and amino and fatty acids. Principal component analysis (PCA) of the NMR dataset revealed α-glucose, sucrose, and isorhamnetin as markers for fruit and stem and unsaturated fatty acids for predominated seeds. Orthogonal projections to latent structure discriminant analysis (OPLS-DA) revealed trigonelline as a major distinctive metabolite in the immature fruit and isorhamnetin as a major distinct marker in the mature fruit. UPLC-MS/MS analysis using feature-based molecular networks revealed diverse chemical classes viz. steroidal saponins, N-containing metabolites, phenolics, fatty acids, and lipids as the constitutive metabolome in Balanites. Gas chromatography-mass spectroscopy (GC-MS) profiling of primary metabolites led to the detection of 135 peaks belonging to sugars, fatty acids/esters, amino acids, nitrogenous, and organic acids. Monosaccharides were detected at much higher levels in ripe fruit and disaccharides in predominate unripe fruits, whereas B. aegyptiaca vegetative parts (leaves and stem) were rich in amino acids and fatty acids. The antidiabetic compounds, viz, nicotinic acid, and trigonelline, were detected in all parts especially unripe fruit in addition to the sugar alcohol D-pinitol for the first time providing novel evidence for B. aegyptiaca use in diabetes. In vitro cytotoxic activity revealed the potential efficacy of immature fruit and seeds as cytotoxic agents against human prostate cancer (PC3) and human colorectal cancer (HCT-116) cell lines. Collectively, such detailed profiling of parts provides novel evidence for B. aegyptiaca medicinal uses.

Publikation

Rajakumara, E.; Abhishek, S.; Nitin, K.; Saniya, D.; Bajaj, P.; Schwaneberg, U.; Davari, M. D.; Structure and cooperativity in substrate–enzyme interactions: Perspectives on enzyme engineering and inhibitor design ACS Chem. Biol. 17 266-280 (2022) DOI: 10.1021/acschembio.1c00500

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