IPB Halle: Leibniz-Institut für Pflanzenbiochemie Deutsch

Lange Nacht, die Wissen schafft

4. Juli 2025 am IPB
IPB-Newsletter | April 2025
Wir verstehen Pflanzen!

Der Film zum Institut
Molekulare Signalverarbeitung

Prof. Dr. Steffen Abel
Wie Pflanzen ihrer Umwelt trotzen.
Natur- und Wirkstoffchemie

Prof. Dr. Ludger Wessjohann
Die Chemie der Natur – Basis für Wirkstoffe zur Gesunderhaltung von Mensch und Pflanze.
Biochemie pflanzlicher Interaktionen

Prof. Dr. Tina Romeis
Wechselwirkungen in, von und mit Pflanzen.
Stoffwechsel- und Zellbiologie

Prof. Dr. Alain Tissier
Sekundär jedoch nicht zweitrangig - Die biologischen Funktionen pflanzlicher Sekundärmetaboliten.
Unabhängige Nachwuchsgruppe

Dr. Mariana Schuster

Aktuelles

Geschmack ist vorhersagbar: Mit FlavorMiner.
FlavorMiner heißt das Tool, das IPB-Chemiker und Partner aus Kolumbien jüngst entwickelt haben. Das Programm kann, basierend auf maschinellem Lernen (KI), anhand der…

Im Rahmen der Wirkstofftage am 9. April 2025 verlieh das Leibniz-Forschungsnetzwerk Wirkstoffe den Preis „Leibniz-Wirkstoff des Jahres“ 2025 an Dr. Ibrahim Morgan, Dr. Robert Rennert, Dr. Tuvshinjargal Budragchaa und Prof.…

Seit Februar 2021 bietet Wolfgang Brandt, ehemaliger Leiter der Arbeitsgruppe Computerchemie am IPB, sein Citizen Science-Projekt zur Pilzbestimmung an. Dafür hat er in regelmäßigen Abständen öffentliche Vorträge zur Vielfalt…

zeige öffentliche Seminare
IPB-Seminar
IPB Doctoral Training Course (DoCou)
Probevorlesung
Progress Report MetaCom
Seminare am Campus
Verteidigungen
Andere

Export .ics

Stellenausschreibungen

Laborantin bzw. Technischer Assistent*in (m/w/d) (9/2025)

Datum: 08.04.2025 Referenznummer: 9/2025

Publikationen

Suchfilter

Zeige Ergebnisse 1 bis 3 von 3.

Ergebnisse als:
Druckansicht
Endnote (RIS)
BibTeX
Tabelle: CSV | HTML

Publikation

Leonova, T.; Ihling, C.; Saoud, M.; Frolova, N.; Rennert, R.; Wessjohann, L. A.; Frolov, A.; Does filter-aided sample preparation provide sufficient method linearity for quantitative plant shotgun proteomics? Front. Plant Sci. 13 874761 (2022) DOI: 10.3389/fpls.2022.874761

Due to its outstanding throughput and analytical resolution, gel-free LC-based shotgun proteomics represents the gold standard of proteome analysis. Thereby, the efficiency of sample preparation dramatically affects the correctness and reliability of protein quantification. Thus, the steps of protein isolation, solubilization, and proteolysis represent the principal bottleneck of shotgun proteomics. The desired performance of the sample preparation protocols can be achieved by the application of detergents. However, these compounds ultimately compromise reverse-phase chromatographic separation and disrupt electrospray ionization. Filter-aided sample preparation (FASP) represents an elegant approach to overcome these limitations. Although this method is comprehensively validated for cell proteomics, its applicability to plants and compatibility with plant-specific protein isolation protocols remain to be confirmed. Thereby, the most important gap is the absence of the data on the linearity of underlying protein quantification methods for plant matrices. To fill this gap, we address here the potential of FASP in combination with two protein isolation protocols for quantitative analysis of pea (Pisum sativum) seed and Arabidopsis thaliana leaf proteomes by the shotgun approach. For this aim, in comprehensive spiking experiments with bovine serum albumin (BSA), we evaluated the linear dynamic range (LDR) of protein quantification in the presence of plant matrices. Furthermore, we addressed the interference of two different plant matrices in quantitative experiments, accomplished with two alternative sample preparation workflows in comparison to conventional FASP-based digestion of cell lysates, considered here as a reference. The spiking experiments revealed high sensitivities (LODs of up to 4 fmol) for spiked BSA and LDRs of at least 0.6 × 102. Thereby, phenol extraction yielded slightly better recoveries, whereas the detergent-based method showed better linearity. Thus, our results indicate the very good applicability of FASP to quantitative plant proteomics with only limited impact of the protein isolation technique on the method’s overall performance.

Publikation

Leonova, T.; Shumilina, J.; Kim, A.; Frolova, N.; Wessjohann, L.; Bilova, T.; Frolov, A.; Agar-based polyethylene glycol (PEG) infusion model for pea (Pisum sativum L.) — perspectives of translation to legume crop plants Biol. Commun. 67 236-244 (2022) DOI: 10.21638/spbu03.2022.309

Publikation

Balarynová, J.; Klčová, B.; Sekaninová, J.; Kobrlová, L.; Cechová, M. Z.; Krejčí, P.; Leonova, T.; Gorbach, D.; Ihling, C.; Smržová, L.; Trněný, O.; Frolov, A.; Bednář, P.; Smýkal, P.; The loss of polyphenol oxidase function is associated with hilum pigmentation and has been selected during pea domestication New Phytol. 235 1807–1821 (2022) DOI: 10.1111/nph.18256

Mehr erhalten

Lange Nacht, die Wissen schafft

IPB-Newsletter | April 2025

Wir verstehen Pflanzen!

Molekulare Signalverarbeitung

Natur- und Wirkstoffchemie

Biochemie pflanzlicher Interaktionen

Stoffwechsel- und Zellbiologie

Unabhängige Nachwuchsgruppe

Aktuelles

+++ Newsticker Wissenschaft #181 +++ Maschinelles Lernen +++

Preisverleihung zu den Wirkstofftagen: “Leibniz-Wirkstoff des Jahres 2025” geht an IPB-Team für Krebsforschungsprojekt

Pilzsachverständige in Sachsen-Anhalt: Jubiläumsstimmung zur Frühjahrstagung

Stellenausschreibungen

Laborantin bzw. Technischer Assistent*in (m/w/d) (9/2025)

Publikationen

Suchfilter