logo ipb
logo ipb mobile
x
  • Deutsch
  • English
Benutzeranmeldung
  • Forschung
    • Leitbild und Forschungsprofil

    • Molekulare Signalverarbeitung

      • Sekretariat & Alle Mitarbeiter
      • Technische Ausstattung MSV
      • Publikationen
      • Forschungsgruppen
        • Nährstoffperzeption
          • Projekte
          • Mitarbeiter
          • Publikationen
          • Kooperationen
        • Symbiose-Signaling
          • Projekte
          • Mitarbeiter
          • Publikationen
          • Kooperationen
        • Jasmonat-Signaling
          • Projekte
          • Mitarbeiter
          • Publikationen
          • Kooperationen
    • Natur- und Wirkstoffchemie

      • Sekretariat & Alle Mitarbeiter
      • Technische Ausstattung NWC
      • Publikationen
      • Forschungsgruppen
        • Wirkstoffe
          • Projekte
          • Mitarbeiter
          • Publikationen
          • Kooperationen
        • Naturstoffe & Metabolomics
          • Projekte
          • Mitarbeiter
          • Publikationen
          • Kooperationen
        • Biotechnologie
          • Projekte
          • Mitarbeiter
          • Publikationen
          • Kooperationen
        • Biofunktionale Synthese
          • Projekte
          • Mitarbeiter
          • Publikationen
          • Kooperationen
        • Computerchemie
          • Projekte
          • Mitarbeiter
          • Publikationen
          • Kooperationen
        • Daten & Ressourcen
          • Projekte
          • Mitarbeiter
          • Publikationen
          • Kooperationen
    • Biochemie pflanzlicher Interaktionen

      • Sekretariat & Alle Mitarbeiter
      • Technische Ausstattung BPI
      • Publikationen
      • Forschungsgruppen
        • Kalzium-abhängige Proteinkinasen, CDPKs
          • Projekte
          • Mitarbeiter
          • Publikationen
          • Kooperationen
        • Zelluläre Signaltransduktion
          • Projekte
          • Mitarbeiter
          • Publikationen
          • Kooperationen
        • Metaboliten-basierte Abwehrmechanismen
          • Projekte
          • Mitarbeiter
          • Publikationen
          • Kooperationen
        • Zellkernprozesse in der pflanzlichen Abwehr
          • Projekte
          • Mitarbeiter
          • Publikationen
          • Kooperationen
    • Stoffwechsel- und Zellbiologie

      • Sekretariat & Alle Mitarbeiter
      • Technische Ausstattung SZB
      • Publikationen
      • Forschungsgruppen
        • Glanduläre Trichome und Isoprenoidbiosynthese
          • Projekte
          • Mitarbeiter
          • Publikationen
          • Kooperationen
        • Jasmonatfunktion & Mykorrhiza
          • Projekte
          • Mitarbeiter
          • Publikationen
          • Kooperationen
        • Phenylpropanstoffwechsel
          • Projekte
          • Mitarbeiter
          • Publikationen
          • Kooperationen
        • Synthetische Biologie
          • Projekte
          • Mitarbeiter
          • Publikationen
          • Kooperationen
    • Unabhängige Nachwuchsgruppen

      • Forschungsgruppen
        • Rezeptorbiochemie
          • Projekte
          • Mitarbeiter
          • Publikationen
          • Kooperationen
    • Program Center MetaCom

      • Sekretariat & Alle Mitarbeiter
      • Publikationen
      • Unser Equipment
      • Forschungsgruppen
        • MetaCom Metabolomics-Einheit
          • Projekte
          • Mitarbeiter
          • Publikationen
          • Methoden
        • MetaCom Analytisches Labor
          • Projekte
          • Mitarbeiter
          • Publikationen
          • Methoden
        • Computergestützte Pflanzenbiochemie
          • Projekte
          • Mitarbeiter
          • Publikationen
          • Kooperationen
        • MetaCom Juniorforschungsgruppe
          • Projekte
          • Mitarbeiter
    • Publikationen

    • Gute Wissenschaftliche Praxis

    • Forschungsförderung

    • Netzwerke und Verbundprojekte

      • Verbundprojekte als Koordinator
        • Abgeschlossene Projekte als Koordinator
      • Verbundprojekte als Partner
        • Beendete Projekte als Partner
      • Netzwerke
    • Symposien und Kolloquien

      • Vorträge
        • IPB-Seminare
      • Leibniz Plant Biochemistry Symposia
    • Alumni-Forschungsgruppen

      • Forschungsgruppen
        • Auxin-Signaltransduktion
          • Projekte
          • Publikationen
        • Bioorganische Chemie
          • Projekte
          • Publikationen
        • Designer-Glykane
          • Projekte
          • Publikationen
        • Jasmonat-Wirkungsweise
          • Publikationen
        • Proteinerkennung und -abbau
          • Projekte
          • Publikationen
        • Regulatorische RNAs (MLU-assoziiert)
          • Projekte
          • Publikationen
        • Signalintegration
          • Projekte
          • Publikationen
        • Ubiquitinierung in der Immunantwort
          • Projekte
          • Publikationen
        • Zelluläre Koordination
          • Projekte
          • Publikationen
  • Infrastruktur
    • Datenbanken und Tools

      • XCMS
      • Rdisop
      • CAMERA
      • MetShot
      • MassBank
      • MetFrag
      • MetFamily
      • PaCeQuant
      • CytoskeletonAnalyzer
      • GoldenMutagenesis
      • cisHighlight
      • FlagScreen
      • RootDetection
    • Technische Ausstattung

    • Zellbiologie-Plattform

    • Gewächshäuser und Phytokammern

    • Bibliothek

      • Online Public Access Catalogue, OPAC
      • Elektronische Zeitschriftenbibliothek, EZB
      • Angebote für Mitarbeiter
  • Institut
    • Organigramm

    • Leitung und Gremien

      • Stiftungsrat
      • Wissenschaftlicher Beirat
      • Geschäftsführung / Direktorium
      • Wissenschaftlicher Institutsrat
      • Beauftragte
      • Personalrat
      • Satzung
    • Administration und Infrastruktur

      • Sekretariat & Alle Mitarbeiter
      • Arbeitsgruppen
        • Personal
        • Finanzen
        • Einkauf
        • IT & Geräteservice
        • Versuchsgärtnerei
        • Gebäude & Liegenschaften
        • Bibliothek
        • Digitalisierung
    • Energiemanagement

      • Ziele & Maßnahmen
      • Energiemanagementteam
    • Vielfalt, Familie, Chancengleichheit

      • Diversität
      • Chancengleichheit
      • Familienfreundlichkeit
      • Fort- und Weiterbildungen
      • Eingliederung und Gesundheit
      • Allgemeines Gleichbehandlungsgesetz (AGG)
    • Öffentliche Ausschreibungen

    • Patente und Lizenzen

    • IPB Welcoming Culture

    • Gästehäuser

    • IPB-Lageplan

    • Geschichte des Instituts

      • Bildergalerie zur Historie
      • Alte Filmsequenzen zum Institut
      • Historischer Massenspektrograph
    • Alumni

      • Karrieresprungbrett IPB
  • Karriere
    • Datenschutzhinweise für Bewerber

    • Doktorandenprogramm

      • Doktorandenvertretung
      • DoCou - Doctoral Training Courses
      • Plant Science Student Conference
    • Postdoktoranden

    • Berufsausbildung

  • Öffentlichkeit
    • Aktuelles

      • 2024
      • 2023
      • 2022
      • Archiv Aktuelles
        • 2021
        • 2020
        • 2019
        • 2018
        • 2017
        • 2016
        • 2015
        • 2014
        • vor 2014
    • Newsticker Wissenschaft

      • Newsticker 2024
      • Newsticker 2023
      • Newsticker 2022
      • Archiv Newsticker
        • Newsticker 2021
        • Newsticker 2020
        • Newsticker 2019
    • Pressemitteilungen

      • 2024
      • 2023
      • 2022
      • Archiv Pressemitteilungen
        • 2021
        • 2020
        • 2019
        • 2018
        • 2017
        • 2016
        • 2015
        • 2014
        • 2013
        • 2012
        • 2011
        • 2010
        • 2009
        • 2008
        • 2007
        • 2006
        • 2005
        • 2004
        • 2003
        • 2002
    • IPB Pressespiegel

    • LANGE NACHT, DIE WISSEN SCHAFFT: PROGRAMM

    • IPB Newsletter

    • IPB Geschichtsbuch

    • Scientific Reports / Research Highlights

    • Veranstaltungen

      • 2024 Lange Nacht der Wissenschaft
      • 2024 Leibniz Plant Biochemistry Symposium
      • Archiv Veranstaltungen
    • Cover Art

    • Citizen Science: Pilzberatung

      • Das Reich der Pilze
      • Pilzberatung
      • Forschung an Pilzen
  • Kontakt
    • Anfahrt

    • Mitarbeiterverzeichnis

    • Impressum

    • Datenschutz

    • Barrierefreiheit

  1. Startseite
  2. Forschung
  3. Publikationen

    • Leitbild und Forschungsprofil
    • Trenner 0
    • Molekulare Signalverarbeitung
      • Sekretariat & Alle Mitarbeiter
      • Technische Ausstattung MSV
      • Publikationen
      • Forschungsgruppen
        • Nährstoffperzeption
        • Symbiose-Signaling
        • Jasmonat-Signaling
    • Natur- und Wirkstoffchemie
      • Sekretariat & Alle Mitarbeiter
      • Technische Ausstattung NWC
      • Publikationen
      • Forschungsgruppen
        • Wirkstoffe
        • Naturstoffe & Metabolomics
        • Biotechnologie
        • Biofunktionale Synthese
        • Computerchemie
        • Daten & Ressourcen
    • Biochemie pflanzlicher Interaktionen
      • Sekretariat & Alle Mitarbeiter
      • Technische Ausstattung BPI
      • Publikationen
      • Forschungsgruppen
        • Kalzium-abhängige Proteinkinasen, CDPKs
        • Zelluläre Signaltransduktion
        • Metaboliten-basierte Abwehrmechanismen
        • Zellkernprozesse in der pflanzlichen Abwehr
    • Stoffwechsel- und Zellbiologie
      • Sekretariat & Alle Mitarbeiter
      • Technische Ausstattung SZB
      • Publikationen
      • Forschungsgruppen
        • Glanduläre Trichome und Isoprenoidbiosynthese
        • Jasmonatfunktion & Mykorrhiza
        • Phenylpropanstoffwechsel
        • Synthetische Biologie
    • Unabhängige Nachwuchsgruppen
      • Forschungsgruppen
        • Rezeptorbiochemie
    • Program Center MetaCom
      • Sekretariat & Alle Mitarbeiter
      • Publikationen
      • Unser Equipment
      • Forschungsgruppen
        • MetaCom Metabolomics-Einheit
        • MetaCom Analytisches Labor
        • Computergestützte Pflanzenbiochemie
        • MetaCom Juniorforschungsgruppe
    • Trenner 1
    • Publikationen
    • Gute Wissenschaftliche Praxis
    • Forschungsförderung
    • Trenner
    • Netzwerke und Verbundprojekte
      • Verbundprojekte als Koordinator
        • Abgeschlossene Projekte als Koordinator
      • Verbundprojekte als Partner
        • Beendete Projekte als Partner
      • Netzwerke
    • Symposien und Kolloquien
      • Vorträge
        • IPB-Seminare
      • Leibniz Plant Biochemistry Symposia
    • Trenner
    • Alumni-Forschungsgruppen
      • Forschungsgruppen
        • Auxin-Signaltransduktion
        • Bioorganische Chemie
        • Designer-Glykane
        • Jasmonat-Wirkungsweise
        • Proteinerkennung und -abbau
        • Regulatorische RNAs (MLU-assoziiert)
        • Signalintegration
        • Ubiquitinierung in der Immunantwort
        • Zelluläre Koordination

Suchfilter

  • Typ der Publikation
    • Bücher und Buchkapitel (3)
      Publikation (1)
  • Erscheinungsjahr
    • 2017 (2)
      2018 (1)
      2019 (4)
      2020 (1)
      2023 (1)
  • Journal / Buchreihe / Preprint-Server Nach Häufigkeit alphabetisch sortiert
    • Methods Mol. Biol. (2)
      0 (1)
      J. Exp. Bot. (1)
  • Autor Nach Häufigkeit alphabetisch sortiert
    • Wessjohann, L. A. (23)
      Hussain, H. (16)
      Hause, B. (12)
      Frolov, A. (11)
      Neumann, S. (11)
      Brandt, W. (7)
      Green, I. R. (7)
      Kaluđerović, G. N. (7)
      Porzel, A. (7)
      Ziegler, J. (7)
      Bürstenbinder, K. (6)
      Franke, K. (6)
      Hoehenwarter, W. (6)
      Rivera, D. G. (6)
      Scheel, D. (6)
      Tissier, A. (6)
      Weissenborn, M. J. (6)
      Wessjohann, L. (6)
      Abbas, G. (5)
      Abel, S. (5)
      Arnold, N. (5)
      Eschen-Lippold, L. (5)
      Farag, M. A. (5)
      Peters, K. (5)
      Rajjou, L. (5)
      Ruttkies, C. (5)
      Wasternack, C. (5)
      Ali, I. (4)
      Dissmeyer, N. (4)
      Drača, D. (4)
      Ehrlich, A. (4)
      Francioso, A. (4)
      Hause, G. (4)
      Knorrscheidt, A. (4)
      Lee, J. (4)
      Maksimović-Ivanić, D. (4)
      Marillonnet, S. (4)
      Mijatović, S. (4)
      Möller, B. (4)
      Pahnke, J. (4)
      Ricardo, M. G. (4)
      Salek, R. M. (4)
      Westermann, B. (4)
      Al-Harrasi, A. (3)
      Döll, S. (3)
      Fobofou, S. A. T. (3)
      Hankemeier, T. (3)
      Haug, K. (3)
      Ho, J. (3)
      Hock, K. J. (3)
      Hommelsheim, R. (3)
      Ihling, C. (3)
      Khan, A. (3)
      Koenigs, R. M. (3)
      Krajnović, T. (3)
      Krohn, M. (3)
      Lukasheva, E. (3)
      Medvedev, S. (3)
      Mielke, S. (3)
      Mosca, L. (3)
      Méndez, Y. (3)
      Naumann, C. (3)
      Poeschl, Y. (3)
      Püllmann, P. (3)
      Ried, M. K. (3)
      Rocca-Serra, P. (3)
      Rosahl, S. (3)
      Schober, D. (3)
      Schreiber, T. (3)
      Schymanski, E. L. (3)
      Soboleva, A. (3)
      Stellmach, H. (3)
      Thévenot, E. A. (3)
      Treutler, H. (3)
      Vasco, A. V. (3)
      Voiniciuc, C. (3)
      Alka, O. (2)
      Athmer, B. (2)
      Badshah, A. (2)
      Baldermann, S. (2)
      Bathe, U. (2)
      Bergmann, S. (2)
      Bilova, T. (2)
      Boland, W. (2)
      Brackhan, M. (2)
      Bruelheide, H. (2)
      Brüning, T. (2)
      Burse, A. (2)
      Capuccini, M. (2)
      Cascante, M. (2)
      Chantseva, V. (2)
      Corrêa dos Santos, C. H. (2)
      Csuk, R. (2)
      Dietz, S. (2)
      Dreher, D. (2)
      Eiriz, I. (2)
      Emami Khoonsari, P. (2)
      Foguet, C. (2)
      Fu, N. (2)
      Gasperini, D. (2)
  • Erscheinungsjahr
  • Typ der Publikation
Aktive Filter: Erscheinungsjahr: 2019 Autor Nach Häufigkeit alphabetisch sortiert: Möller, B. Alle Filter entfernen
Zeige Ergebnisse 1 bis 4 von 4.
  • Ergebnisse als:
  • Druckansicht
  • Endnote (RIS)
  • BibTeX
  • Tabelle: CSV | HTML
Ergebnisse pro Seite:
  • 1

Publikation

Mitra, D.; Klemm, S.; Kumari, P.; Quegwer, J.; Möller, B.; Poeschl, Y.; Pflug, P.; Stamm, G.; Abel, S.; Bürstenbinder, K.; Microtubule-associated protein IQ67 DOMAIN5 regulates morphogenesis of leaf pavement cells in Arabidopsis thaliana J. Exp. Bot. 70 529-543 (2019) DOI: 10.1093/jxb/ery395
  • Abstract
  • BibText
  • RIS

Plant microtubules form a highly dynamic intracellular network with important roles for regulating cell division, cell proliferation and cell morphology. Its organization and dynamics are coordinated by various microtubule-associated proteins (MAPs) that integrate environmental and developmental stimuli to fine-tune and adjust cytoskeletal arrays. IQ67 DOMAIN (IQD) proteins recently emerged as a class of plant-specific MAPs with largely unknown functions. Here, using a reverse genetics approach, we characterize Arabidopsis IQD5 in terms of its expression domains, subcellular localization and biological functions. We show that IQD5 is expressed mostly in vegetative tissues, where it localizes to cortical microtubule arrays. Our phenotypic analysis of iqd5 loss-of-function lines reveals functions of IQD5 in pavement cell (PC) shape morphogenesis. Histochemical analysis of cell wall composition further suggests reduced rates of cellulose deposition in anticlinal cell walls, which correlate with reduced anisotropic expansion. Lastly, we demonstrate IQD5-dependent recruitment of calmodulin calcium sensors to cortical microtubule arrays and provide first evidence for important roles of calcium in regulation of PC morphogenesis. Our work thus identifies IQD5 as a novel player in PC shape regulation, and, for the first time, links calcium signaling to developmental processes that regulate anisotropic growth in PCs.

Bücher und Buchkapitel

Möller, B.; Bürstenbinder, K.; Semi-Automatic Cell Segmentation from Noisy Image Data for Quantification of Microtubule Organization on Single Cell Level 199-203 (2019) ISBN:978-1-5386-3641-1 DOI: 10.1109/ISBI.2019.8759145
  • Abstract
  • BibText
  • RIS

The structure of the microtubule cytoskeleton provides valuable information related to morphogenesis of cells. The cytoskeleton organizes into diverse patterns that vary in cells of different types and tissues, but also within a single tissue. To assess differences in cytoskeleton organization methods are needed that quantify cytoskeleton patterns within a complete cell and which are suitable for large data sets. A major bottleneck in most approaches, however, is a lack of techniques for automatic extraction of cell contours. Here, we present a semi-automatic pipeline for cell segmentation and quantification of microtubule organization. Automatic methods are applied to extract major parts of the contours and a handy image editor is provided to manually add missing information efficiently. Experimental results prove that our approach yields high-quality contour data with minimal user intervention and serves a suitable basis for subsequent quantitative studies.

Bücher und Buchkapitel

Möller, B.; Zergiebel, L.; Bürstenbinder, K.; Quantitative and Comparative Analysis of Global Patterns of (Microtubule) Cytoskeleton Organization with CytoskeletonAnalyzer2D Cvrčková, F. & Žárský, V., eds. Methods Mol. Biol. 1992 151-171 (2019) ISBN:978-1-4939-9469-4 DOI: 10.1007/978-1-4939-9469-4_10
  • Abstract
  • BibText
  • RIS

The microtubule cytoskeleton plays important roles in cell morphogenesis. To investigate the mechanisms of cytoskeletal organization, for example, during growth or development, in genetic studies, or in response to environmental stimuli, image analysis tools for quantitative assessment are needed. Here, we present a method for texture measure-based quantification and comparative analysis of global microtubule cytoskeleton patterns and subsequent visualization of output data. In contrast to other approaches that focus on the extraction of individual cytoskeletal fibers and analysis of their orientation relative to the growth axis, CytoskeletonAnalyzer2D quantifies cytoskeletal organization based on the analysis of local binary patterns. CytoskeletonAnalyzer2D thus is particularly well suited to study cytoskeletal organization in cells where individual fibers are difficult to extract or which lack a clearly defined growth axis, such as leaf epidermal pavement cells. The tool is available as ImageJ plugin and can be combined with publicly available software and tools, such as R and Cytoscape, to visualize similarity networks of cytoskeletal patterns.

Bücher und Buchkapitel

Möller, B.; Poeschl, Y.; Klemm, S.; Bürstenbinder, K.; Morphological Analysis of Leaf Epidermis Pavement Cells with PaCeQuant Cvrčková, F. & Žárský, V., eds. Methods Mol. Biol. 1992 329-349 (2019) ISBN:978-1-4939-9469-4 DOI: 10.1007/978-1-4939-9469-4_22
  • Abstract
  • BibText
  • RIS

Morphological analysis of cell shapes requires segmentation of cell contours from input images and subsequent extraction of meaningful shape descriptors that provide the basis for qualitative and quantitative assessment of shape characteristics. Here, we describe the publicly available ImageJ plugin PaCeQuant and its associated R package PaCeQuantAna, which provides a pipeline for fully automatic segmentation, feature extraction, statistical analysis, and graphical visualization of cell shape properties. PaCeQuant is specifically well suited for analysis of jigsaw puzzle-like leaf epidermis pavement cells from 2D input images and supports the quantification of global, contour-based, skeleton-based, and pavement cell-specific shape descriptors.

  • 1

Drucken

  • Startseite
  • Aktuelles
  • Vorträge
  • Publikationen
  • Öffentliche Ausschreibungen
  • IPB Remote & Mail
  • Impressum
  • Datenschutz
  • Barrierefreiheit
  • Die Leibniz-Gemeinschaft
  • Wege zu einer pflanzenbasierten Wirtschaft
  • Martin-Luther Universität Halle
  • Erfolgsfaktor Familie
  • TOTAL E-QUALITY
  • Forschung
    • Leitbild und Forschungsprofil

    • Molekulare Signalverarbeitung

    • Natur- und Wirkstoffchemie

    • Biochemie pflanzlicher Interaktionen

    • Stoffwechsel- und Zellbiologie

    • Unabhängige Nachwuchsgruppen

    • Program Center MetaCom

    • Publikationen

    • Gute Wissenschaftliche Praxis

    • Forschungsförderung

    • Netzwerke und Verbundprojekte

    • Symposien und Kolloquien

    • Alumni-Forschungsgruppen

  • Infrastruktur
    • Datenbanken und Tools

    • Technische Ausstattung

    • Zellbiologie-Plattform

    • Gewächshäuser und Phytokammern

    • Bibliothek

  • Institut
    • Organigramm

    • Leitung und Gremien

    • Administration und Infrastruktur

    • Energiemanagement

    • Vielfalt, Familie, Chancengleichheit

    • Öffentliche Ausschreibungen

    • Patente und Lizenzen

    • IPB Welcoming Culture

    • Gästehäuser

    • IPB-Lageplan

    • Geschichte des Instituts

    • Alumni

  • Karriere
    • Datenschutzhinweise für Bewerber

    • Doktorandenprogramm

    • Postdoktoranden

    • Berufsausbildung

  • Öffentlichkeit
    • Aktuelles

    • Newsticker Wissenschaft

    • Pressemitteilungen

    • IPB Pressespiegel

    • LANGE NACHT, DIE WISSEN SCHAFFT: PROGRAMM

    • IPB Newsletter

    • IPB Geschichtsbuch

    • Scientific Reports / Research Highlights

    • Veranstaltungen

    • Cover Art

    • Citizen Science: Pilzberatung

  • IPB Remote & Mail