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Möhle, L.; Schwarzová, B.; Krohn, M.; Stefan, S. M.; Pahnke, J.; Using a qPCR device to screen for modulators of ABC transporter activity: A step-by-step protocol J. Pharmacol. Toxicol. Methods 104 106882 (2020) DOI: 10.1016/j.vascn.2020.106882
  • Abstract
  • BibText
  • RIS

IntroductionAdenosine triphosphate (ATP)-binding cassette (ABC) transporters are transmembrane proteins which actively transport a large variety of substrates across biological membranes. ABC transporter overexpression can be the underlying cause of multidrug resistance in oncology. Moreover, it has been revealed that increased ABCC1 transporter activity can ameliorate behavioural changes and Aβ pathology in a rodent model of Alzheimer's disease and it is currently tested in AD patients.MethodsFinding substances that modulate ABC transporter activity (inhibitors and activators) is of high relevance and thus, different methods have been developed to screen for potential modulators. For this purpose, we have developed a cell-based assay to measure the kinetics of ABCC1-mediated efflux of a fluorescent dye using a common qPCR device (Agilent AriaMx).ResultsWe validated the specificity of our method with vanadate and benzbromarone controls. Furthermore, we provide a step-by-step protocol including statistical analysis of the resulting data and suggestions how to modify the protocol specifically to screen for activators of ABCC1.DiscussionOur approach is biologically more relevant than cell-free assays. The continuous detection of kinetics allows for a more precise quantification compared with assays with single end-point measurements.

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