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Datenbanken und Tools

Die Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler des IPB entwickeln zahlreiche Ressourcen, Tools und Datenbanken für die Pflanzenforschung sowie Bio- und Chemoinformatik. Diese können als Download oder online genutzt werden.

Computerbasierte Massenspektrometrie

XCMS

C/MS und GC/MS Signalverarbeitung

CAMERA

Sammlung von annotationsbezogenen Verfahren für MS-Daten

MassBank

Tandem MS Referenzdatenbank      

MetFamily

Zur Identifizierung von regulierten Metabolitenfamilien.

Rdisop

Summenformel Berechnung          

MetShot

Erfassung und Verarbeitung von Tandem Massenspektren im Hochdurchsatz


MetFrag

In‐silico Metabolitenidentifikation

Bioinformatik

cisHighlight

Visualisierung von cis-Elementen in Promotorsequenzen

PaCeQuant

Ein Programm, das automatisch die Form von Blattepidermis-Zellen quantifiziert. PaCeQuant ist Teil der MiToBo-Erweiterung für Fiji/ImageJ.

CytoskeletonAnalyzer2D

Automatische Analyse und Quantifizierung von Strukturelementen in Mikroskopiebildern

FlagScreen

Kalibrierung von Aequorin-basierten Kalziummessungen       

RootDetection

Ein Programm zur Erkennung von Wurzeln und Vermessung von Wurzellängen in Fotos von Pflanzenwurzeln.

Protein Modelle

Proteinmodelle, die durch Molecular Modelling und homologie-basierte Modellierung erstellt wurden.

Diese Seite wurde zuletzt am 06.12.2019 geändert.

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