Datenbanken und Tools
Die Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler des IPB entwickeln zahlreiche Ressourcen, Tools und Datenbanken für die Pflanzenforschung sowie Bio- und Chemoinformatik. Diese können als Download oder online genutzt werden.
Computerbasierte Massenspektrometrie
Bioinformatik
PaCeQuant
Ein Programm, das automatisch die Form von Blattepidermis-Zellen quantifiziert. PaCeQuant ist Teil der MiToBo-Erweiterung für Fiji/ImageJ.
GoldenMutagenesis
Design von Primern für den Aminosäurenaustausch und die Sättigungsmutagenese mit Golden-Gate-Klonierung.
cisHighlight
Visualisierung von cis-Elementen in Promotorsequenzen
RootDetection
Ein Programm zur Erkennung von Wurzeln und Vermessung von Wurzellängen in Fotos von Pflanzenwurzeln.
CytoskeletonAnalyzer2D
Automatische Analyse und Quantifizierung von Strukturelementen in Mikroskopiebildern
Protein Modelle
Proteinmodelle, die durch Molecular Modelling und homologie-basierte Modellierung erstellt wurden.
FlagScreen
Kalibrierung von Aequorin-basierten Kalziummessungen
