Datenbanken und Tools
Die Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler des IPB entwickeln zahlreiche Ressourcen, Tools und Datenbanken für die Pflanzenforschung sowie Bio- und Chemoinformatik. Diese können als Download oder online genutzt werden.
Computerbasierte Massenspektrometrie
Bioinformatik
PaCeQuant
Ein Programm, das automatisch die Form von Blattepidermis-Zellen quantifiziert. PaCeQuant ist Teil der MiToBo-Erweiterung für Fiji/ImageJ.
GoldenMutagenesis
Design von Primern für den Aminosäurenaustausch und die Sättigungsmutagenese mit Golden-Gate-Klonierung.
cisHighlight
Visualisierung von cis-Elementen in Promotorsequenzen
CytoskeletonAnalyzer2D
Automatische Analyse und Quantifizierung von Strukturelementen in Mikroskopiebildern
FlagScreen
Kalibrierung von Aequorin-basierten Kalziummessungen
RootDetection
Ein Programm zur Erkennung von Wurzeln und Vermessung von Wurzellängen in Fotos von Pflanzenwurzeln.