18.02.2021
+++ Newsticker Wissenschaft #74 +++ Ecometabolomics +++
Big Data für Gräser und Kräuter.
Ein Bioinformatikerteam des IPB hat gemeinsam mit iDiv-Partnern aus Halle, Jena und Wageningen einen umfangreichen Metabolomics-Datensatz für die Biodiversitätsforschung zusammengestellt. Er enthält die Metabolitenprofile von 13 Gras- und Krautpflanzenarten, die in Pflanzengemeinschaften unterschiedlichen Diversitätsgrades in natürlichem Grünland gewachsen sind. Das Pflanzenmaterial wurde zu verschiedenen Zeitpunkten der Vegetationsperiode 2017 gesammelt und kontinuierlich aufbereitet. Neben den mit UPLC-ESI-Qq-TOF-MS erstellten Metabolitenprofildaten der oberirdischen Pflanzenteile erfasste man auch die sichtbaren Eigenschaften der untersuchten Arten, wie Größe, Anzahl der Blätter u.ä. Nach einer Rohdatenvorverarbeitung erfolgten die Vorbereitung der Daten für statistische Analysen sowie Fehlerkorrekturen und Gültigkeitsprüfungen der sichtbaren Merkmale. Der umfassende Datensatz bietet die Möglichkeit, den metabolischen Fingerabdruck verschiedener Arten in natürlichen Pflanzengemeinschaften zu untersuchen und daraus Erkenntnisse zur pflanzlichen Anpassung an veränderte Umweltbedingungen zu gewinnen.
Die Datenerhebungen fanden im Rahmen des Jena-Experiments statt, das seit 2002 als eine der längsten Biodiversitätsstudien Europas durchgeführt wird. Mit Hilfe von neuartigen analytischen Methoden sollen in diesem DFG-Projekt die ökologischen und evolutionären Mechanismen der Biodiversität und deren Rolle für die Funktionsfähigkeit von Ökosystemen untersucht werden.
