Informationen zur Abteilung
Bioinformatik & MassenspektrometrieVerschiedene wissenschaftlich anspruchsvolle Themen können im Rahmen der Zusammenarbeit zwischen der MLU Halle und dem IPB als Diplomarbeiten, Projekte oder an studentische Hilfskräfte vergeben werden. Neben den hier aufgeführten konkreten Projekten können weitere Themen in einem persönlichen Gespräch entwickelt werden. BewerberInnen melden sich bitte bei Dr. Steffen Neumann oder den weiteren Mitgliedern der Arbeitsgruppe.
Metabolomics Datawarehouse Unter einem Datawarehouse versteht man eine auf spezielle Anfragen optimierte Datenbank. Oft werden Daten aus operativen (normalisierten) Schemata in das (meist denormalisierte) Warehouse-Schema transformiert. Für die Metabolomics-Datenbanken am IPB soll ein Warehouse mit dem Framework BioMart-Framework erstellt werden, das anspruchsvolle Abfragemöglichkeiten und Verknüpfungen von experimentellen Daten und öffentlichen Datenquellen bietet. Dazu gehört die Erstellung des ETL-Prozesses mit dem MartBuilder, die Konfiguration des Web -Frontends-MartView und die Einbindung der Daten in die Workflow-Engine-Taverna. |
Forschungsgruppen
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